성기능 장애의 치료는 1970년대 이전에는 주로 정신역동적 정신치료를 시행하였지만, 요즘에는 행동치료적인 다양한 방법의 성치료가 시행되고 있어서, 다른 정신병리를 가지고 있는 경우에는 정신치료가 유용하지만, 그렇지 않은 경우에는 다른 방법의 성치료를 시행하게 된다. 가장 널리 이용되는 성기능 장애 치료법은 1970년대 Masters & Johnson에 의해 시작된 ’이중 성치료(dual-sex therapy)’로, 성적 문제는 다른 결혼생활 문제의 일부분이고 배우자와의 전반적인 관계를 다루어야 하고, 성적 문제가 두 사람 모두에게 영향을 미치는 것이라는 기본 개념 하에 성적 배우자 두 사람 모두를 포함시켜 치료하는 방법이다.
이 치료법에서는 성기능의 생리적 측면 및 심리적 측면, 성행위에 대한 부부의 태도, 의사소통능력의 평가부터 시작하여 각각 부부가 가진 성문제에 따라 특정 행위를 지시하기도 한다. 이런 방법을 통해서 부부는 점차 성적 자신감을 찾게 되고 언어적 의사소통 및 비언어적인 의사소통인 성적 의사소통의 방법을 배우게 된다.
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